教堂的另外一個(gè)重點(diǎn)是彩色玻璃，在教堂內(nèi)的彩色玻璃都非常特別，用玻璃制作圖像臺(tái)凸顯出圣經(jīng)里的人物或是故事，如為基督教徒會(huì)被這里的彩色玻璃所吸引，在教堂內(nèi)部總共有56個(gè)玻璃窗，31個(gè)圓形的玫瑰圖案以及25個(gè)彩色幅彩色玻璃窗的精美圖案，但是在這56個(gè)玻璃窗只有4個(gè)是最完整無(wú)瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由當(dāng)?shù)刂鹘痰木用襁M(jìn)行一些整修，而這些彩色玻璃窗都是由法國(guó)沙特爾省的LorinFirm所制造。

這些彩色玻璃畫并非由一整片玻璃構(gòu)成，而是由幾百個(gè)小彩色玻璃組合而成，這些小玻璃是通過加入諸如錳或鈷一類的化學(xué)劑而成的，這種玻璃保持著半透明狀態(tài)，根據(jù)所添加的材料的不同，呈現(xiàn)不同的顏色，在中間用鉛線連接在一起，構(gòu)成教堂中的彩色玻璃畫
大教堂是為上帝而建造的，這座古老建筑的每一個(gè)細(xì)節(jié)，從精美的手工石頭，到無(wú)與倫比的中世紀(jì)彩色玻璃，都在講述著耶穌基督的故事，也充滿了各樣的見證。
彩繪玻璃鑲嵌畫在羅馬式時(shí)期已開始使用，但由于該建筑的窗戶面積較小，因此沒有明顯的裝飾效果；當(dāng)圣德尼教堂開始建造時(shí)，窗戶的面積大大增加，這是因?yàn)樘K熱要求教堂內(nèi)有連續(xù)的彩色光線，玻璃畫便成為哥特式藝術(shù)的組成部分